临检中心专家详细解读我国NGS诊断检测监管之路

在过去10年里，DNA测序变得更快且更便宜，这主要得益于下1代测序技术的迅猛发展。如今，NGS技术正快速地被广泛利用于常规临床实践中，利用领域包括实体肿瘤、血液恶性肿瘤、遗传性疾病、沾染性疾病、产前检测和胚胎植入前遗传学诊断/筛查。

中国政府已启动了NGS临床检测的监管工作，也在尽大地努力使NGS诊断检测标准化。在确实验机是指可以做3种或3种以上实验的机器保安全和有效性的同时寻求适合的方法，保证该领域的创新性，支持精准医疗的发展和进步。近日，临检中心副主任李金明和张瑞博士在Science增刊中撰文解读了中国NGS诊断检测的政策。

我国NGS诊断检测的监管历程

2014年之前，我国基因测序行业处于无监管状态，2014年2月，国家食品和叫停了所有的NGS业务，对行业进行集中整理，推出了1系列的NGS监管政策。

我国NGS诊断检测的监管体系

目前，全部基因测序行业触及细分产业众多，包括商业公司、临检中心、医院、仪器试剂、不同的技术平台等，所以触及的监管部门也比较多，主要包括和各地区、卫生和计划生育委员会和国家。

的宏观计划

从宏观上制定测序产业的发展计划。2015年6月，发布了《国家发展改革委关于实行新兴产业重大工程包的通知》，提到要重点发展基因检测等新型医疗技术，并将在3年时间内建设30个基因检测技术利用示范中心，快速推动基因检测临床利用和基因检测仪器试剂的国产化;另外，地方还参与NIPT等项目的定价。

CFDA的监督管理

CFDA主要是对测序链上的仪器、试剂、分析软件进行监管。CFDA要求NGS商业诊断系统中的所有仪器、试剂、打包卖给实验室的软件在进入临床利用前必须取得批准。2014年1月，CFDA发布了《食品药品监管总局办公厅关于基因分析仪等3个产品分类界定的通知》，规定将基因分析仪作为3类医疗器械进行管理;2014年2月，CFDA和联合发布通知明确指出，基因测序产品需经CFDA审批注册。

的审查和规范

主要是对展开基因测序机构的资质进行审查和规范，具体由3个部份监管，分别是医政医改局、妇幼司和临检中心。

医政医改局和妇幼司相继批准了全国各省市159家临床试点进行产前基因测序、胚胎植入前遗传学诊断、遗传病诊断和肿瘤诊断与医治等4个专业的高通量测序服务，颁布了《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南》，《肿瘤个体化医治检测技术指南》等规范。临检中心的职责是承当临床检验质量管理与控制工作，运行全国临床检验室间质量评价计划，建立、利用临床检验参考系统，对展开基因检测服务的医学实验室进行评估和验收。

另外，试点实验室必须根据临检中心管理文件《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》取得政府批准，基于NGS技术的所有临床检测必须遵守文件中的相干规定。实验室应当建立标准操作程序、遵照所有的质控标准、记录每一个检测的性能。依照SOP和QC标准，NGS流程应当在每一个实验室中到达预期运行特性。内部质控和外部质控评估对实验室评估NGS结果也是的。

我国NGS诊断监管面临的挑战

随着NGS技术的广泛利用，临床实验室可利用疾病靶基因panel、外显子测序和全基因组测序进行分析。与传统的份子检测不同，NGS检测的监管面临着若干挑战，李金明副在Science增刊中总结了以下几点。

对CFDA而言，NGS检测需要创新的方法来确保分析和临床的有效性。

首先，与传统的方法利用单个或1定量因夙来诊断单个或1些疾病不同，N最重要的是*不含任何有毒物资GS检测能够辨认人类基因组中的大量变体，因此有效分析每个变体几近是不切实际的。虽然评价具有代表性的突变类型也许是1种有效的方法来证明NGS平台的性能，但需要时间来建立不同临床领域NGS检测的评价新指标。

第2，NGS检测不但辨认出有临床意义的变体，也能辨认大量意义不明确的变体。因此不同的变体的临床验证应有不同的要求。

第3，NGS检测的预期用处是针对特定病人群体、药物或疾病。根据美国国家癌症研究所MATCH项目，医治试剂的选择应当基于NGS靶向分析所得的具体份子结果，而不是癌症类型。随着临床研究的快速发展，CFDA必须重新斟酌审批流程以扩大获批试剂的预期利用。

NGS技术的出现一样给也带来了挑战。虽然试点实验室需要根据《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》来展开NGS检测，由于NGS临床检测比传统份子检测复杂很多，因此迫切需要制定新的监管标准。

最近几年来，美国疾病控制与预防中心、美国医学遗传学学会和美国病理学家学会针对NGS方法的有效验证、分析进程监控和变异报告制定了指南。但是，将这些要求转化为常规对实验室而言还是1个挑战。

我国NGS诊断检测的利用现状

经历了无监管叫停监管，当前我国NGS诊断检测的利用现状如何?哪些NGS产品取得了国家批固化剂可加热至50℃准?检测实验室水平如何?李金明在Science增刊中解析了这些问题。

2014年6月30日，CFDA批准了NGS诊断产品BGISEQ1000和BGISEQ100，主要用于检测胎儿染色体非整倍体。在中国，NIPT已成NGS利用为成熟的领域，且多个临床验证结果也证实了它的高灵敏度、特异性和阴性预测值。

到目前为止，有5款NGS测序仪取得了CFDA的批准，分别为华大基因的BGISEQ⑴00、 BGISEQ⑴000、贝瑞和康的NextSeq CN500，达安基因的DA8600和博奥生物的BioelectronSeq 4000，同时CFDA批准了与这些仪器配套的NIPT检测。但是，目前在其他临床领域如肿瘤相干的遗传突变检测、遗传评估和PGD/PGS，还没有获批的商业化NGS产品。

2014年4月，推出了试点项目，并向NGS实验室授与许可资质。目前，已有9家实验室获批展开NIPT检测，6家获批展开PGD/PGS检测，26家获批展开肿瘤检测，18家获批展开遗传病检测。

为了评估NGS检测的实验室水平，2014年，临检中心推出了基于大范围并行测序的21、18、133体检测的实验室间质评项目。评估结果表明，大多数参与的实验室都采取取得CFDA批准的试剂，并且传统的用单1材料增加墙体厚度来到达保温的作法已不能适应节能和环保的为NIPT提供了可靠的诊断能力。

2015年，临检中心在全国范围内展开了实验室间质评工作，评估了NGS技术检测体细胞突变的有效性。参加评估的实验室包括取得国家批准展开肿瘤NGS检测的26家实验室和和正在申请NGS检测许可的实验室。这些实验室提供的所有检测均为实验室开发的检测。64家实验室中33家的检测性能到达了标准，但只有17家实验室能正确辨认临检中心panel中DNA样本的所有突变。这些结果意味着实验室急需加强肿瘤体细胞突变的NGS检测能力，这与检测进程的复杂性有关。

小结

最近几年来，国家对NGS诊断检测的监管不断完善。去年中检院发布了《第2代测序技术检测试剂质量评价通用技术指点原则》，提高了NGS的准入门坎，指点基因检测及NGS的规范、公道利用。同时，我国首部《2代测序技术利用于临床肿瘤精准医学诊断的共鸣》也于去年发布，为2代测序技术利用于临床肿瘤驱动基因分析提供相干指点性建议，并规范临床实践。